Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00474Q9P2X8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00474Q9P2X8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms