Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCOR3Q9P2K3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCOR3Q9P2K3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCOR3Q9P2K3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCOR3Q9P2K3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms