Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP35Q9P2H5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP35Q9P2H5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP35Q9P2H5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP35Q9P2H5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms