Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD7Q9P2D1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHD7Q9P2D1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD7Q9P2D1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD7Q9P2D1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms