Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0X4

CACNA1I, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1I, humanhuman

Predictions only

Length 2,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1IQ9P0X4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1IQ9P0X4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1IQ9P0X4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNA1IQ9P0X4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1IQ9P0X4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1IQ9P0X4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1IQ9P0X4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms