Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP53Q9NZM5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOP53Q9NZM5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOP53Q9NZM5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP53Q9NZM5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms