Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
C9orf78Q9NZ63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
C9orf78Q9NZ63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
C9orf78Q9NZ63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
C9orf78Q9NZ63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
C9orf78Q9NZ63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
C9orf78Q9NZ63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
C9orf78Q9NZ63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
C9orf78Q9NZ63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
C9orf78Q9NZ63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
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