Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK12Q9NYV4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CDK12Q9NYV4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDK12Q9NYV4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDK12Q9NYV4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDK12Q9NYV4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms