Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC5A4Q9NY91 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC5A4Q9NY91 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A4Q9NY91 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms