Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA8Q9NY65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA8Q9NY65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA8Q9NY65 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA8Q9NY65 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms