Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM161AQ9NX61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM161AQ9NX61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM161AQ9NX61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms