Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF9

RNF216, E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF216Q9NWF9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF216Q9NWF9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF216Q9NWF9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF216Q9NWF9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms