Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
IFT57Q9NWB7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IFT57Q9NWB7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IFT57Q9NWB7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT57Q9NWB7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT57Q9NWB7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IFT57Q9NWB7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms