Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PCBP2-208ENST00000546652 823 ntTSL 511.48□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 311.01□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.678e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 38.51□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 FAM91A1-202ENST00000517912 681 ntTSL 36.57□□□□□ -1.368e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 FAM91A1-205ENST00000519721 4650 ntTSL 1 (best)6.28□□□□□ -1.48e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 PCBP2-220ENST00000550910 449 ntTSL 32.95□□□□□ -1.948e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 FAM91A1-208ENST00000521704 438 ntTSL 31.73□□□□□ -2.138e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 SOX2-OT-241ENST00000626948 836 ntTSL 513.46□□□□□ -0.251e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 SOX2-OT-256ENST00000630482 1012 ntTSL 512.01□□□□□ -0.491e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 SOX2-OT-215ENST00000493521 1239 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 SOX2-OT-226ENST00000597347 1342 ntTSL 59.79□□□□□ -0.841e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 SOX2-OT-214ENST00000493116 560 ntTSL 45.21□□□□□ -1.581e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 SOX2-OT-204ENST00000469278 561 ntTSL 41.83□□□□□ -2.121e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.221e-38■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 PIM1-203ENST00000479509 675 ntTSL 212.84□□□□□ -0.357e-35■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 PIM1-202ENST00000468243 818 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.657e-35■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 43.4
RBM22Q9NW64 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 43.4
RBM22Q9NW64 NINL-207ENST00000496509 735 ntTSL 513.42□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 43.4
RBM22Q9NW64 SMOC1-203ENST00000553839 551 ntTSL 511.3□□□□□ -0.62e-13■■■■■ 43.3
RBM22Q9NW64 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)6.05□□□□□ -1.443e-10■■■■■ 43.3
RBM22Q9NW64 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 511.01□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 58.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 319.49■□□□□ 0.718e-10■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 317.54■□□□□ 0.48e-10■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 215.65■□□□□ 0.18e-10■■■■■ 43.2
RBM22Q9NW64 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.862e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-210ENST00000519569 2355 ntTSL 219.63■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 219.45■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-215ENST00000520266 878 ntTSL 318.69■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 217.79■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 216.28■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 RBBP6-210ENST00000568015 695 ntTSL 316.25■□□□□ 0.195e-19■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 313.09□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-19■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-240ENST00000562292 735 ntTSL 510.46□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 39.98□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 RBBP6-207ENST00000564314 3361 ntTSL 28.04□□□□□ -1.125e-19■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 37.93□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 56.73□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 RBBP6-209ENST00000567686 1138 ntTSL 55.01□□□□□ -1.615e-19■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.685e-19■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.735e-19■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.825e-19■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 520.49■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.39□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 BPTF-216ENST00000582467 1015 ntTSL 53.44□□□□□ -1.862e-8■■■■■ 43.1
RBM22Q9NW64 CD164-209ENST00000512212 590 ntTSL 214.48□□□□□ -0.094e-9■■■■■ 43
RBM22Q9NW64 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 43
RBM22Q9NW64 CCNB1-204ENST00000506572 1331 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 43
RBM22Q9NW64 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 43
RBM22Q9NW64 CCNB1-206ENST00000508407 780 ntTSL 27.57□□□□□ -1.24e-8■■■■■ 43
RBM22Q9NW64 CCNB1-203ENST00000505500 1190 ntTSL 1 (best)7.36□□□□□ -1.234e-8■■■■■ 43
RBM22Q9NW64 CCNB1-205ENST00000507798 767 ntTSL 34.32□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 43
RBM22Q9NW64 PABPC4-220ENST00000525669 582 ntTSL 28.93□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 42.9
RBM22Q9NW64 PABPC4-222ENST00000527718 746 ntTSL 56.38□□□□□ -1.392e-11■■■■■ 42.9
RBM22Q9NW64 CERS2-208ENST00000460664 850 ntTSL 315.05■□□□□ -07e-7■■■■■ 42.7
RBM22Q9NW64 CERS2-204ENST00000368949 1002 ntTSL 514.25□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 42.7
RBM22Q9NW64 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.745e-10■■■■■ 42.6
RBM22Q9NW64 AGPAT5-204ENST00000523586 468 ntTSL 418.14■□□□□ 0.495e-10■■■■■ 42.6
RBM22Q9NW64 AGPAT5-203ENST00000523234 2525 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-10■■■■■ 42.6
RBM22Q9NW64 AGPAT5-202ENST00000518327 852 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.985e-10■■■■■ 42.6
RBM22Q9NW64 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.514e-9■■■■■ 42.5
RBM22Q9NW64 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.554e-9■■■■■ 42.5
RBM22Q9NW64 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.74e-9■■■■■ 42.5
RBM22Q9NW64 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.984e-9■■■■■ 42.5
RBM22Q9NW64 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.268e-16■■■■■ 42.4
RBM22Q9NW64 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 42.4
RBM22Q9NW64 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 42.4
RBM22Q9NW64 USP48-206ENST00000464577 2089 ntTSL 27.25□□□□□ -1.258e-10■■■■■ 42.3
RBM22Q9NW64 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 42.3
RBM22Q9NW64 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-9■■■■■ 42.3
RBM22Q9NW64 PRKAB1-203ENST00000537400 555 ntTSL 314.32□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 42.3
RBM22Q9NW64 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 42.3
RBM22Q9NW64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.814e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.754e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 NPLOC4-217ENST00000574897 2365 ntTSL 224.09■■□□□ 1.454e-10■■■■■ 42.2
RBM22Q9NW64 MTCH1-204ENST00000460219 1572 ntTSL 222.57■■□□□ 1.24e-10■■■■■ 42.2
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 324 ms