Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RBM28Q9NW13 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RBM28Q9NW13 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM28Q9NW13 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM28Q9NW13 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms