Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDFIP2Q9NV92 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDFIP2Q9NV92 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDFIP2Q9NV92 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms