Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL17Q9NRX2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL17Q9NRX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL17Q9NRX2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL17Q9NRX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms