Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DUOX2Q9NRD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DUOX2Q9NRD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
DUOX2Q9NRD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
DUOX2Q9NRD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
DUOX2Q9NRD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms