Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF4Q9NR80 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF4Q9NR80 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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