Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TAPT1-AS1-203ENST00000573950 510 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-14■■■■■ 509.3
UTP3Q9NQZ2 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.25□□□□□ -1.575e-16■■■■■ 508.8
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 503.4
UTP3Q9NQZ2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.237e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC2-207ENST00000555443 1756 ntTSL 222.08■■□□□ 1.137e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.127e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC2-208ENST00000555739 1696 ntTSL 521.58■■□□□ 1.057e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC137-205ENST00000574200 437 ntTSL 221.08■□□□□ 0.977e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.913e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.97e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.813e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SPATA24-201ENST00000302091 909 ntTSL 217.68■□□□□ 0.423e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.337e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.173e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.163e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.047e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 GAREM2-203ENST00000496070 273 ntTSL 314.78□□□□□ -0.043e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-204ENST00000449372 3930 ntTSL 514.52□□□□□ -0.083e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 AXIN1-203ENST00000457798 334 ntTSL 314.41□□□□□ -0.12e-20■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-201ENST00000293748 4556 ntTSL 513.69□□□□□ -0.223e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-207ENST00000628646 4264 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.243e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.287e-41■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 KIF5A-201ENST00000286452 3527 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 KIF5A-202ENST00000455537 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2B3-204ENST00000439363 892 ntTSL 310.32□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SPATA24-206ENST00000512761 484 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 AL031118.1-201ENST00000607727 2955 ntBASIC9.84□□□□□ -0.833e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-205ENST00000470232 394 ntTSL 39.44□□□□□ -0.93e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SPATA24-202ENST00000450845 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.013e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 SPATA24-207ENST00000514983 451 ntTSL 55.92□□□□□ -1.463e-27■■■■■ 503.1
UTP3Q9NQZ2 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.56e-9■■■■■ 501.3
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.038e-8■■■■■ 500.1
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 500.1
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 500.1
UTP3Q9NQZ2 KMT5A-207ENST00000478781 725 ntTSL 530.33■■■□□ 2.452e-8■■■■■ 498.5
UTP3Q9NQZ2 KMT5A-206ENST00000462311 747 ntTSL 521.69■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 498.5
UTP3Q9NQZ2 PPARGC1B-205ENST00000434684 2457 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 497.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-9■■■■■ 495.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.493e-9■■■■■ 495.8
UTP3Q9NQZ2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 494.8
UTP3Q9NQZ2 PIGU-201ENST00000217446 1632 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 494.8
UTP3Q9NQZ2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 494.8
UTP3Q9NQZ2 MPRIP-210ENST00000577514 513 ntTSL 523.97■■□□□ 1.434e-7■■■■■ 494
UTP3Q9NQZ2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 493.8
UTP3Q9NQZ2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 493.8
UTP3Q9NQZ2 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 493.8
UTP3Q9NQZ2 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 493.8
UTP3Q9NQZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.791e-10■■■■■ 493.8
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.592e-9■■■■■ 492
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 492
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-205ENST00000468577 1842 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 492
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-215ENST00000497355 1778 ntTSL 1 (best)8.25□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 492
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-9■■■■■ 492
UTP3Q9NQZ2 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 490.4
UTP3Q9NQZ2 RGS12-210ENST00000506631 1530 ntTSL 1 (best)25.98■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 489.8
UTP3Q9NQZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.172e-10■■■■■ 486.8
UTP3Q9NQZ2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.78□□□□□ -0.045e-13■■■■■ 484.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.89□□□□□ -0.515e-13■■■■■ 484.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.77□□□□□ -0.535e-13■■■■■ 484.6
UTP3Q9NQZ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.354e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 KLF13-206ENST00000558921 440 ntTSL 328.09■■■□□ 2.092e-11■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TEAD4-207ENST00000543035 801 ntTSL 527.83■■■□□ 2.054e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-207ENST00000533521 1128 ntTSL 223.54■■□□□ 1.364e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.262e-11■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.244e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.224e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-213ENST00000479834 681 ntTSL 322.06■■□□□ 1.122e-58■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-207ENST00000482474 495 ntTSL 522.04■■□□□ 1.124e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.114e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-206ENST00000440813 851 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.68■■□□□ 1.064e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.054e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.94e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.884e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-209ENST00000454501 1048 ntTSL 320.34■□□□□ 0.852e-58■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.824e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-203ENST00000524877 5772 ntTSL 219.76■□□□□ 0.754e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-210ENST00000496468 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.754e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-208ENST00000582276 546 ntTSL 419.54■□□□□ 0.724e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.574e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TCEA2-213ENST00000475792 655 ntTSL 218.4■□□□□ 0.544e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-205ENST00000437110 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.07■□□□□ 0.484e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.474e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.414e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.384e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.364e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-208ENST00000537091 1220 ntTSL 216.86■□□□□ 0.294e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-202ENST00000309862 3028 ntTSL 216.75■□□□□ 0.274e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 PGAP3-205ENST00000577337 587 ntTSL 316.69■□□□□ 0.264e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 BEST1-204ENST00000524926 2404 ntTSL 216.58■□□□□ 0.254e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC4-208ENST00000467308 409 ntTSL 316.55■□□□□ 0.244e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 YPEL5-206ENST00000470120 653 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-211ENST00000463074 252 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-58■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-39■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.074e-20■■■■■ 484.4
UTP3Q9NQZ2 CDHR2-207ENST00000513031 849 ntTSL 315.13■□□□□ 0.014e-20■■■■■ 484.4
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