Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FSCN3Q9NQT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FSCN3Q9NQT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms