Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SSU72Q9NP77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSU72Q9NP77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSU72Q9NP77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms