Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCB6Q9NP58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCB6Q9NP58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB6Q9NP58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB6Q9NP58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms