Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SacsQ9JLC8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SacsQ9JLC8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SacsQ9JLC8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms