Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prg3Q9JL95 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prg3Q9JL95 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prg3Q9JL95 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prg3Q9JL95 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms