Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfr2Q9JKX3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfr2Q9JKX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tfr2Q9JKX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfr2Q9JKX3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms