Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb3Q9JKS4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ldb3Q9JKS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms