Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrQ9JKK8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AtrQ9JKK8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms