Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3m1Q9JKC8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap3m1Q9JKC8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms