Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cngb3Q9JJZ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cngb3Q9JJZ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms