Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gfra4Q9JJT2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gfra4Q9JJT2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms