Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XAB2Q9HCS7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XAB2Q9HCS7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XAB2Q9HCS7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.3 ms