Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3GQ9HC16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3GQ9HC16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOBEC3GQ9HC16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC3GQ9HC16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms