Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SUDS3Q9H7L9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUDS3Q9H7L9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUDS3Q9H7L9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms