Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSS3Q9H6R3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSS3Q9H6R3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACSS3Q9H6R3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms