Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STN1Q9H668 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STN1Q9H668 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STN1Q9H668 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STN1Q9H668 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms