Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NXF3Q9H4D5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NXF3Q9H4D5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXF3Q9H4D5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF3Q9H4D5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms