Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4AQ9H3S1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4AQ9H3S1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms