Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX1Q9H3N1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMX1Q9H3N1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMX1Q9H3N1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMX1Q9H3N1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms