Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIOBPQ9H2D6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIOBPQ9H2D6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIOBPQ9H2D6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms