Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP2Q9H175 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP2Q9H175 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP2Q9H175 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms