Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WWP1Q9H0M0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WWP1Q9H0M0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WWP1Q9H0M0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WWP1Q9H0M0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms