Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC113Q9H0I3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC113Q9H0I3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms