Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1EQ9GZS1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1EQ9GZS1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1EQ9GZS1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms