Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Brd4Q9ESU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Brd4Q9ESU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Brd4Q9ESU6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
Brd4Q9ESU6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Brd4Q9ESU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Brd4Q9ESU6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms