Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff4Q9ESC8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff4Q9ESC8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff4Q9ESC8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff4Q9ESC8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff4Q9ESC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aff4Q9ESC8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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