Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cse1lQ9ERK4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cse1lQ9ERK4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cse1lQ9ERK4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cse1lQ9ERK4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cse1lQ9ERK4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cse1lQ9ERK4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms