Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn3Q9ERG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn3Q9ERG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn3Q9ERG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn3Q9ERG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms