Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tfip11Q9ERA6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfip11Q9ERA6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tfip11Q9ERA6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tfip11Q9ERA6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms