Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox9Q9EQM5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox9Q9EQM5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox9Q9EQM5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox9Q9EQM5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox9Q9EQM5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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